El Sevilla Atlético retomó en la temporada 2006-2007 al escudo que poseía en sus orígenes, siendo el contorno igual al del primer equipo, con forma de corazón, pero recorrido por uno de los monumentos más emblemáticos de la ciudad de Sevilla, la Giralda. De izquierda a derecha lo recorre una franja roja. Un balón de fútbol antiguo y la siglas SAC, de Sevilla Atlético Club entrelazadas completan el escudo.